Pages

Hiển thị các bài đăng có nhãn ngôn ngữ R. Hiển thị tất cả bài đăng
Hiển thị các bài đăng có nhãn ngôn ngữ R. Hiển thị tất cả bài đăng

Danh sách bài giảng trên youtube.com

Thứ Năm, 13 tháng 11, 2014
Thể theo lời yêu cầu của nhiều bạn, tôi trình bày dưới đây một danh sách bài giảng về phân tích dữ liệu và y học thực chứng (EBM).  Danh sách này tính đến ngày 10/11/2014. Danh sách gồm 40 bài giảng về phân tích dữ liệu, 7 bài về biểu đồ, và 4 bài về EBM. Trong tương lai, dĩ nhiên, danh sách sẽ được cập nhật vài lần nữa khi có bài mới. Hiện nay, tôi cố gắng tải bài giảng mới hàng tuần để các bạn tiện theo dõi.



Bài giảng về EBM và dịch tễ học:






Bài giảng về cách xây dựng biểu đồ (ggplot2)  










Bài giảng về phân tích dữ liệu với R

















Bài giảng 24: Phân tích hậu định (posthoc analysis) trong ANOVA


























Read more ...

Bài giảng G5: Xây dựng biểu đồ tương quan

Thứ Năm, 6 tháng 11, 2014
Xin thông báo cùng các bạn quan tâm, tôi đã upload bài thứ 5 trong loạt bài bàn về phân tích dữ liệu bằng biểu đồ. Bài này (G5) hướng dẫn cách xây dựng một biểu đồ, mà thuật ngữ tiếng Anh gọi là scatterplot và tôi dịch là biểu đồ tương quan, bằng cách dùng ggplot2 trong R.



Đây là một dạng biểu đồ rất phổ biến trong khoa học mỗi khi nói đến phân tích tương quan, nhưng có khi được trình bày rất dở. Tôi xem rất nhiều bài báo khoa học xuất bản ở VN (tôi chỉ nói ngành y) thì tôi thấy tác giả trình bày quá đơn giản, không xứng đáng có trong bài báo. Thường thường họ chỉ trình bày mối tương quan đơn giản nhất, tức là chỉ có 2 biến X và Y. Mà, có khi họ dấu giếm những dữ liệu ngoại vi (chắc sợ bị nghi ngờ )! Nhưng họ không hiểu rằng nếu họ trình bày dữ liệu quá đẹp thì đó là một cách gieo nghi ngờ tốt nhất, bởi vì trong thực tế làm gì có những thí nghiệm hay nghiên cứu trơn tru!

Vấn đề trở nên thú vị hơn là mối tương quan giữa X và Y được trình bày theo một biến thứ 3. Hấp dẫn và có nhiều thông tin hơn nữa là mối tương quan phải có một đường biểu diễn thể hiện những nét tiêu biểu của mối tương quan. Bài này sẽ hướng dẫn các bạn làm chuyện hấp dẫn đó qua vài ví dụ cụ thể với dữ liệu thực tế. Địa chỉ bài giảng là:


Tuần qua chẳng có bạn đọc nào gửi mail khen cả, nên chẳng có gì bên lề để chia sẻ hay PR J.

Read more ...

Bài giảng 37: Đánh giá tầm quan trọng của biến tiên lượng

Thứ Hai, 20 tháng 10, 2014
Tiếp tục loạt bài mô hình hồi qui tuyến tính đa biến, bài này sẽ hướng dẫn cách đánh giá tầm quan trọng của biến tiên lượng. Trong các mô hình phân tích dạng hồi qui tuyến tính, một câu hỏi rất quan trọng là làm sao đánh giá được tầm quan trọng của biến tiên lượng (X) trên biến phụ thuộc . Chẳng hạn như biết được yếu tố nào quan trọng giúp nhà khoa học tập trung can thiệp vào yếu tố đó để có kết quả tối ưu. Tuy câu hỏi rất quan trọng như thế, nhưng sách giáo khoa hoàn toàn không đề cập đến vấn đề này, đơn giản vì cho đến nay, phương pháp tính toán khá phức tạp. Trong bài giảng này, tôi sẽ giới thiệu một phương pháp khả dĩ (dùng kĩ thuật bootstrap chỉ có trong R) để giải quyết câu hỏi đánh giá tầm quan trọng của biến tiên lượng. Tôi đã áp dụng phương pháp này cho một bài báo mới đây về hormone và thấy rất có ích. Tôi hi vọng các bạn cũng sẽ thích thú với cách đặt câu hỏi và giải pháp. 

Địa chỉ bài giảng: https://www.youtube.com/watch?v=HsU3cDpQJko&list=UU21dOPe-YHO3Gw6BRbyeotQ

Một bạn đọc Nguyễn Thanh Tùng ghi thêm và có một ý hay liên quan đến vấn đề này:

Cảm ơn GS, bài giảng hay và tôi biết thêm được phương pháp Lmg để tính độ quan trọng của các biến tiên lượng trong mô hình hồi quy. Tôi sẽ thử với bài toán đang làm, trong bài giảng tôi thấy Lmg hình như chỉ đánh giá từng biến, GS cho hỏi là cách làm này có đánh giá được tầm quan trọng của các nhóm biến không? Có đánh giá được các biến có quan hệ XOR với nhau được ko? Có làm việc được với số chiều cao không?

Tôi cũng đã gặp bài toán này và xin trao đổi cách làm như sau: Tôi dùng phương pháp dựa theo kinh nghiệm (Heuristic), hình dung ta có 1 nhóm người A, B, C, D.. cùng khênh 1 vật nặng. Xét lần lượt từng người trong nhóm, giả sử xét anh A, ta thay thế A bởi 1 người A' rất yếu và quan sát hiện tượng. Nếu mọi việc vẫn bình thường thì chứng tỏ anh A ko quan trọng, ngược lại thì anh A có tầm ảnh hưởng đến kết quả cuối cùng. Bài báo của nhóm làm về hồi quy dùng random forests được đăng ở link dưới , GS hoặc anh chị em nào quan tâm xin cùng trao đổi http://link.springer.com/article/10.1007/s10994-014-5452-1

Read more ...